Alle Modellteile sind konsistent miteinander verknüpft. Der Verkehrsbereich liefert z. B. den Treibstoffverbrauch in Litern, der mit den Literpreisen multipliziert unmittelbar in die monetäre Vorleistungsnachfrage der Industrie und die Konsumnachfrage der privaten Haushalte eingeht.

Änderungen der Steuersätze auf Treibstoffe führen dann einerseits zu geänderten Steuereinnahmen und vielfältigen ökonomischen Anpassungsprozessen, andererseits lösen die Preisänderungen für Treibstoffe ihrerseits Verhaltensanpassungen aus, die im Modellrahmen erfasst werden. Das Modell wird voll interdependent gelöst, d. h., dass die Wirkungen einer Maßnahme auf alle Modellvariablen gleichzeitig erfasst werden und keine Effekte „verloren gehen“.

PANTA RHEI enthält eine Fülle gesamtwirtschaftlicher Größen auf Basis der amtlichen Statistik, vor allem Volkswirtschaftliche und Umweltökonomische Gesamtrechnungen inklusive Input-Output-Rechnung, und erlaubt sektorale Aussagen zu 63 Wirtschaftsbereichen. Außerdem sind die Energiebilanzen inklusive der Satellitenbilanzen für erneuerbare Energien nach AG Energiebilanzen sowie die Emissionsdaten des UBA erfasst.

Das Modell ist in den vergangenen Jahren vielfältig eingesetzt worden, u. a. im Rahmen der Energieszenarien 2010, zur Ermittlung von Nettobeschäftigungseffekten der erneuerbaren Energien und als Basis für den Fortschrittsbericht zum Monitoring der Energiewende.